美国斯坦福大学的 Bernard Kim 和同事在7 月 18 日出版的开放获取期刊PLOS Biology上报告称，大量新的基因组序列数据填补了果蝇生命之树的重大空白。
果蝇是生物学研究中的经典模式生物，也是首批进行全基因组测序的物种之一。果蝇家族有 4,400 多个物种，其多样性可以为我们了解进化模式和过程提供参考。但这些物种中只有一小部分进行了基因组测序，而且大多数已发表的果蝇基因组序列都来自一组非常有限的物种，这些物种具有代表性的近交实验室菌株。
为了解决这个问题，研究人员对果蝇科 179 种苍蝇进行了基因组测序，包括野生的苍蝇、保存的博物馆标本和实验室饲养的菌株。
他们采用结合最新短读和长读测序技术的混合测序方法，从有限的材料中生成低成本、高质量的基因组序列。
他们利用新的基因组序列和之前发表的数据，绘制了果蝇科 360 个物种的系统发育树，进一步加深了我们对这些物种进化关系的理解。他们还比对了近 300 个果蝇基因组，作为未来比较基因组学研究(如全基因组比对)的开源工具。