费城儿童医院 (CHOP) 的研究人员开发了一种新工具来帮助分析从空间转录组学技术 (SRT) 收集的数据，该技术同时分析组织中的基因表达和空间位置信息，以精确定位组织哪一层中的哪些细胞可能导致各种疾病。
该研究结果发表在《自然方法》杂志上，使研究人员能够更好地确定和了解新的治疗目标，以优化治疗策略。
SRT 是一种功能强大的工具，具有令人难以置信的多功能性。有些方法可以分析组织上数千个位置的数万个基因，而其他方法则可以在单细胞水平上测量数百个基因。
然而，面对如此多的数据，确定哪些细胞表达哪些基因以及这些基因如何导致疾病可能颇具挑战性。例如，在大脑中，研究人员很难区分哪些基因在其复杂层中的不同类型的细胞和神经元中活跃。
“虽然 SRT 生成的数据很重要，但仅凭数据很难理解如何将这些信息转化为有助于推动发现的整体情况，”资深研究作者、医学博士、哲学博士、CHOP 应用基因组学中心 (CAG) 主任 Hakon Hakonarson 说。